بلتستان از نظر اداري زير نظر مستقيم حكومت مركزي پاكستان اداره مي شود. وزير امور كشمير و مناطق شمالي مستقيما اداره مناطق شمال را به عهده دارد. مناطق شمالي پاكستان به شهرستان‌هاي گيلگيت، بلتستان، گانگچهي، غذر، استور و ديامير تقسيم ميشود. فرمانداران اين مناطق از طرف دولت محلي مناطق شماي منصوب مي شوند. اين شهرستان ها به بخشهاي متعدد و بخشها به دهستانها تقسيم مي شوند، در شهرها شوراي شهر داير است، در شهرستانها شوراي شهرستان و در دهستانها شوراي اتحاديه امور محلي را بررسي مي كنند، در سطح كل مناطق شمالي شوراي قانونگذاري مناطق شمالي براي پروژه‌هاي عمراني بزرگ بودجه فراهم مي كند و به امور عمراني و اجتماعي رسيدگي مي كند، رئيس اين شورا دستيار وزير امور كشمير و مناطق شمالي است. شهر گيلگيت مركز دولت محلي مناطق شمالي است