اين مسجد توسط امير كبير سيد علي همداني در سال783 ه.ق ساخته شد[1]  اين مسجد در مركز خپلو واقع است. مسجد چقچن يكباره ساخته نشده بلكه در مراحل مختلف  به تكميل رسيده است زيرا در سال783 هجري اميركبير بنياد ان را نهاد و قسمتها يي از ان را ساخت ولي ساختمان آن تكميل نشد تا  اين كه در سال911 هجري مير شمس الدين عراقي به آنجا آمد و ساختمان مسجد را تكميل كرد و از آغاز تا تكميل اين مسجد 129 سال وقفه ايجاد شد.

درسال1923 ميلادي(1344 هجري) اين مسجد به طور گسترده تعمير و مرمت شد. ساختار و شكل اين مسجد گواه بر هنر اصيل ايراني و كشميري است.[2] در زمان هاي بعدي نيز اين مسجد چند بار تعمير و بازسازي شده است. درب و پنجره‌ها و كارهاي چوبي اين مسجد از شاهكارهاي هنري آن زمان محسوب مي شود.